4月22日，“四月网”在微博上写道：“我们的捐款去哪了？截止到2014年4月20日8点02分，全国219家基金会参与雅安地震募捐，接收社会捐款16.96亿元，目前已支出款物6.45亿元，占总收入的38%。壹基金一家独大收了近4个亿的捐款，目前拨付4千多万，仅占9%。”
23日凌晨，壹基金秘书长杨鹏在微博上发布长文声明，对“四月网”的质疑做出回应。杨鹏透露，壹基金2013年总支出1.2758亿元，其中雅安紧急救援和过渡安置项目支出4532万元，至于为何支出只占总支出的35%，杨鹏解释称，壹基金的灾后重建诸多项目正在进行中，项目正式落实前不会拨付救助资金，即“支出指的是主要实际执行到位的项目资金支出，在设计方案、招标投标完成前，不会拔付出学校建设资金。”
而继杨鹏的声明之后，同日15：43分，壹基金的创始人李连杰也在来往扎堆上连发两条“有声图片”，首度对壹基金陷质疑事件作出回应。李连杰称“我没有财务章，没有签字权，钱都在国家银行，怎么能转入自己的帐户呢，转出来还不被媒体发现，银行也不知道，也没人追我，又不会被抓到监狱里，谁来教教我？怎么做？我真是想不通，这个事怎么做？”他还调侃道，“媒体朋友，微博、来往、微信的所有朋友，请你们帮忙想想办法，哥几个(壹基金董事)怎么分这3亿？”
4月24日，杨鹏又在微博上发布了“壹基金就四月网微博诽谤壹基金贪污善款三亿元一事”的律师函，称四月网故意歪曲和捏造事实、误导公众，要求其澄清事实、赔礼道歉。在实际上，在4月20日，壹基金就曾在微博上公布“雅安地震近四亿元善款的一周年使用报告”，报告中早已写明，“截至2014年3月31日，超过6,000,000人次向壹基金捐赠385,523,684,98元(款物合计)，已发生救援捐赠支出49,069,931,39元(款物合计)，捐款收入余额336,453,933,59元。”
目前，四月网虽然已经删除了之前质疑“李连杰贪污3亿元”的微博。不过，又转发了实名认证为律师、学者的知名博主吴法天的质疑壹基金的微博，质疑的内容不单单仅询问剩余的3亿善款滞后拨付是否合法，还询问这些资金是如何保值的，且利息又是如何处理的。
